Svc sisteminde reaktörlerin güç ayarlaması açı kontrolü ile yapıldığı için ister istemez akım sinyalinde bozulmalar olmaktadır. Bu bozulmalar da harmonik olarak adlandırılmaktadır. Fakat harmonik üreten tek kaynak svc sistemleri değildir. Bunu da göz önünde bulundurmak lazım. Mesela bilgisayarlar da çok ciddi bir harmonik kaynağıdır. Ama hiçbirimiz bilgisayarlardan vazgeçmeyi düşünmeyiz. Çünkü bu harmonikler belli bir seviyenin altında kalmak şartıyla kabul edilebilirdir. Zaten harmonik seviyeleri çok yüksek olan işletmelerin bunun için bir önlem olarak pasif veya aktif filtreler tesis etmesi zorunludur. Halihazırdaki uygulamalarda bu şekildedir.
Svc sisteminin neden olduğu harmonikle ile ilgili bir husus da şudur: Reaktörlerin açılma yüzdesi azaldıkça toplam harmonik bozulma oranı yükselir fakat reaktörün çektiği toplam akım da azaldığı için harmonikler etkisini kaybeder. Aşağıdaki grafiklerde bu sonuçları görebilirsiniz.
Bir de harmoniklerin nötre etkisi üzerinde durulmuş. Bu etki sadece 3. ve 3ün katları olan harmonikler için geçerlidir. 3. Harmonik dışındakilerin seviyeleri ise ihmal edilebilecek derecede düşüktür. Eğer 3. Harmonikler gerçekten ciddi bir sıkıntı oluşturuyorsa bu da 3. Harmoniği hedefleyen pasif bir filtre ile rahatlıkla çözülebilir.